牙結石形成的原因，主要是由於我們口腔的食物殘渣沒有清理乾淨，卡在牙縫中經過口水的成份而逐日形成。
通常牙結石形成的地方在：下顎前牙的舌側表面，上顎後牙的頰側表面和牙齒的齒頸部，以及口腔黏膜運動不到的牙齒表面等處。牙結石開始時是軟軟的，會因逐漸的鈣化而變硬。
牙結石對口腔而言是一種異物體，它會不斷刺激牙周組織，進而壓迫牙齦，影響血液循環，造成牙周組織的病菌感染，引起牙齦發炎萎縮，形成牙周囊袋。
當牙周囊袋形成後，更容易使細菌往更深層的地方生長，牙菌斑和牙結石會往下不斷地堆積之後，又更進一步的破壞更深的牙周膜，如此不斷的惡性循環的結果，終至牙周支持組織全部破壞殆盡，造成牙周病，若情況嚴重牙齒則難逃拔除的惡運。